发布网友 发布时间:2024-10-24 17:00
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热心网友 时间:2024-11-14 10:08
AFLP反应流程主要包括三个核心步骤:模板DNA制备、酶切片段扩增以及凝胶电泳分析。
1. 模板DNA制备:首先,需要获取高分子量(HMW)的基因组DNA,通常使用如EcoRI、PstI或SacI这样的具有六个碱基识别位点的*性内切酶进行处理。
2. 酶切片段连接:*性片段在T4连接酶的作用下,与预先设计的特定接头相连,生成带有接头的特异性片段,这一步对于后续的扩增至关重要。
3. 预扩增与选择性扩增:DN*段在Taq聚合酶的作用下,通过PCR反应进行预扩增,然后通过AFLP方法进行选择性扩增,这一步确保了目标片段的特异性。
扩增后的产物需要经过处理,变性后在含尿素的聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳分离,以便于观察和分析。
4. 多态性比较与数据分析:通过电泳结果,可以对得到的片段进行多态性比较,挑选出具有差异的片段。进一步,通过特异片段回收克隆,进行深入的分子生物学研究。
在cDNA-AFLP中,这一流程同样应用于转录组DNA的分析,提供了基因表达差异的检测手段。
AFLP技术是一项新的分子标记技术,是基于PCR技术扩增基因组DNA*性片段,基因组DNA先用*性内切酶切割,然后将双链接头连接到DN*段的末端,接头序列和相邻的*性位点序列,作为引物结合位点。