法律分析：因为公司想少交工会经费，因为公司想少承担你们员工的五险一金，因为公司想少承担解除劳动合同或劳动纠纷时支付的赔偿金，因为公司想偷税漏税，少交企业所得税。（公司要求员工每个月贴一千块的发票，说是可以抵扣个人所得税。”并未说明1000元是否全额发放给员工，而且也未说明如果员工凑的发票超过1000元怎么办，个人认为是入费用套现了，而不一定是给员工的。这种情况就是企业虚增费用来逃避所得税。）员工的五险一金是根据上年度平均工资决定的基数，每月1000元不计入工资也就不影响下年度基数的上浮，企业承担的费用会少很多。
员工的工资低，发生劳动纠纷，企业赔偿的也会少一些，因为你每月报销的费用是不计入你的工资的，解除劳动合同赔偿金根据的是过去12个月的平均工资。
当然，你的工资低了也就确实少交了个人所得税，但是少交的这点个税跟企业损害你的利益根本不值一提。