法律分析：公司违法员工不会被牵连。
只要没有违法行为，没有知情不报，就不会被公司牵连。关键是看员工个人有没有参与公司的违法行为，个人有无过错。当劳动者主观上知晓用人单位经营的业务存在违法性而从事，当违法行为被查处后，劳动者不能仅声称是服从单位安排而免于承担法律责任。司法机关在查处违法行为时也需要查明事实，区分责任，在严厉打击违法行为的同时，不要涉及无辜劳动者。但是，个人为进行违法犯罪活动而设立的公司、企业、事业单位实施犯罪的，或者公司、企业、事业单位设立后，以实施犯罪为主要活动的，不以单位犯罪论处。基于该规定，以电信诈骗、非法金融服务、信贷等为主业的公司涉嫌犯罪的，案件往往被定性为共同犯罪，普通员工也将被列为共犯。
公司单位犯罪怎么处罚
1、原则上两罚制：对单位判处罚金（对单位也只能判处罚金），并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员判处刑罚；
2、处罚例外，单罚：仅对单位的直接负责人员判处刑罚；
3、对犯罪单位本身判处刑罚：只能判处罚金刑。
法律依据：《中华人民共和国刑法》
第二十五条 【共同犯罪的概念】共同犯罪是指二人以上共同故意犯罪。二人以上共同过失犯罪，不以共同犯罪论处；应当负刑事责任的，按照他们所犯的罪分别处罚。