1965年,裴端卿出生于湖北省荆州市公安县一个温馨而快乐的教师家庭。从小,身为乡村小学校长的父亲就教育他要热爱科学,长大了做科研工作者。1984年,裴端卿从华中农业大学毕业后,顺利考取了中美生物化学与分子生物学留学项目(CUSBEA),赴美留学。