1、法律法规依据不同，劳动争议调解程序依据的法律法规是《劳动法》、《企业劳动争议处理条例》、《企业劳动争议调解委员会组织及工作规则》等;劳动争议仲裁程序依据的法律法规除《劳动法》、《企业劳动争议处理条例》等。
2、申请的条件不同：调解不是劳动争议的必须程序，而仲裁是通过诉讼解决劳动争议的必须程序。
3、申请时效和处理期限不同：当事人申请调解应当自知道其权利受到侵害之日起30日内，以口头或书面形式向本单位劳动争议调解委员会提出，当事人申请仲裁，应当自知道或应当知道其权利受到侵害之日起60日内，以书面形式向劳动争议仲裁委员会提出。
4、法律效力不同，由劳动争议调解委员会主持达成的调解协议书，不具有强制执行的法律效力，只能依靠双方当事人自觉履行;由劳动争议仲裁委员会主持达成的仲裁调解书自送达之日起即具有法律效力，双方当事人不能重新申请仲裁或向人民法院起诉。
5、处理机构不同。
一、暑假工乱扣工资该怎么办
暑假工乱扣工资可以向劳动监察大队投诉或者向劳动仲裁委员会申请仲裁，不服可起诉。
1、协商解决
劳动者与用人单位就劳动纠纷问题直接进行协商，这不是必经程序，双方可以协商，也可以不协商，完全出于自愿。
2、申请调解
当事人就已经发生的劳动纠纷向劳动纠纷调解委员会申请调解的程序。
调解程序也由当事人自愿选择，调解协议不具有强制执行力，如果一方反悔，同样可以向仲裁机构申请仲裁。
3、仲裁处理
当事人将纠纷提交劳动争议仲裁委员会进行处理的程序，如果想提起诉讼打劳动官司，必须经过仲裁程序，不能直接向人民法院起诉。
4、诉讼解决
诉讼程序的启动是由不服劳动争议仲裁委员会裁决的一方当事人向人民法院提起诉讼后启动的程序。
二、劳动纠纷应如何解决
劳动纠纷的解决方法有：
1、双方协商解决。双方在自愿协商的基础上达成协议；
2、调解。双方不愿自行协商或达成协议的，可以自愿申请企业调解委员会调解。调解不成的，可以申请仲裁；
3、仲裁。一方或双方可以在法定期限内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁；
4、诉讼。当事人对仲裁裁决不服的，可以在规定期限内向基层人民法院起诉。人民法院按照民事诉讼程序审理，实行两审终审制度。法院审判程序是处理劳动争议的最终程序。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第四十二条，仲裁庭在作出裁决之前，应当先行调解。