法律分析：被告人在刑事辩护中遭到法院的指控时，应当依据《中华人民共和国刑事诉讼法》有关规定，积极申辩、举证、辩护，维护自己的合法权益。同时，在法院指控时，被告人也需要注意以下几点：
1. 合法抗辩：被告人可以就案件事实、证据、适用法律等方面提出异议或者抗辩，法院应当依法审查，听取辩论，确保当事人的合法权益。
2. 保护自己的权益：被告人可以依法要求举证、申请延期、申请辩护人等，以保障自己的合法权益。
3. 合法防御：被告人可以依法辩护，以证明自己的无罪或者减轻、免除自己的刑事责任。
法律依据：
《中华人民共和国刑事诉讼法》
第37条 被告人在审判过程中，有权申辩，有权举证，有权进行辩护，法院应当依法审查。
第49条 被告人有权聘请辩护人。
第50条 被告人和辩护人有权在审判过程中对起诉书、证据、有关法律的适用等提出异议或者抗辩。
第84条 在审判活动中，被告人有权申请对尚未询问或者未经充分询问的证人进行询问，也可以申请延期或者中止审理。
第98条 被告人有权申请举证。
第100条 被告人对指控的犯罪事实和证据有异议的，有权提出辩护意见，提出证据，也可以要求证人到庭作证。
第101条 被告人认为自己无罪的，有权申请辩护。
第102条 被告人认为自己有罪，有权在量刑阶段提出情节轻微、认罪态度好等情况，以减轻、免除刑事责任。
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